La majorit\u00e9 des donn\u00e9es concerne la partie amont du bassin versant de la Loire et constitue pour l\u2019essentiel des donn\u00e9es pal\u00e9obotaniques (plus rarement des donn\u00e9es pal\u00e9olimnologiques). Une m\u00e9thode d\u2019analyse multivari\u00e9e (Detrended Correspondence Analysis<\/em>) a \u00e9t\u00e9 effectu\u00e9e sur une partie des donn\u00e9es disponibles.<\/p>\n\n\n\n Cette m\u00e9thode a permis de mettre en \u00e9vidence l\u2019influence importante de l\u2019anthropisation sur la composition des communaut\u00e9s v\u00e9g\u00e9tales ainsi que sa croissance au cours du temps. Une comparaison a \u00e9galement r\u00e9v\u00e9l\u00e9 la pr\u00e9cocit\u00e9 de l\u2019anthropisation aval par rapport \u00e0 l\u2019amont.<\/p>\n\n\n\n Evolution temporelle sur la Loire aval (en ann\u00e9es calibr\u00e9es Before Present) des scores des relev\u00e9s polliniques sur l\u2019axe F1 (n\u00e9gativement corr\u00e9l\u00e9 \u00e0 l\u2019anthropisation). En noir la courbe de tendance polynomiale d\u2019ordre 5. En orange la moyenne mobile d\u2019ordre 2.<\/em><\/p>\n\n\n\n Les objectifs de l\u2019Action 1.2 sont multiples : dresser une liste d\u2019esp\u00e8ces pr\u00e9sentes sur le lit inondable de la Loire, \u00e9valuer l\u2019abondance des esp\u00e8ces au cours du temps (analyse des tendances) et relier ces tendances \u00e0 des param\u00e8tres environnementaux (facteurs m\u00e9t\u00e9orologiques, physico-chimiques, biologiques, etc.).<\/p>\n\n\n\n Phytoplancton<\/strong><\/p>\n\n\n\n Les relev\u00e9s de 24 stations ont \u00e9t\u00e9 exploit\u00e9s pour \u00e9tablir la liste des taxons observ\u00e9s, la plupart correspondant \u00e0 des relev\u00e9s effectu\u00e9s par le Bureau d\u2019\u00e9tudes Bi-Eau pour le compte de l\u2019Agence de l\u2019Eau Loire-Bretagne entre 1991 et 2001 puis de 2005 \u00e0 2011. Pour l\u2019analyse des tendances spatio-temporelles, 6 stations ont \u00e9t\u00e9 utilis\u00e9es sur une p\u00e9riode de 18 ans.<\/p>\n\n\n\n Localisation des stations de pr\u00e9l\u00e8vements de phytoplancton le long de la Loire. En rouge les stations retenues pour l\u2019analyse des tendances temporelles.<\/em><\/p>\n\n\n\n Pr\u00e8s de 710 taxons ont \u00e9t\u00e9 recens\u00e9s sur l\u2019ensemble des station, avec environ 40% des taxons appartenant \u00e0 la classe des Chlorophyc\u00e9es, 30% \u00e0 la classe des Diatomophyc\u00e9es et 11% \u00e0 la classe des Cyanobact\u00e9ries. Evolution de la biomasse totale de phytoplancton sur les 6 stations consid\u00e9r\u00e9es entre 1991 \u00e0 2011<\/em><\/p>\n\n\n\n En ce qui concerne la biomasse, celle-ci chute progressivement sur l\u2019ensemble des stations, d\u00e9clin pour lequel plusieurs pistes d\u2019explications sont envisag\u00e9es : diminution du Phosphore dissous, filtration d\u2019un bivalve invasif, pr\u00e9sence d\u2019\u00e9l\u00e9ments toxiques issus de l\u2019agriculture, hausse des temp\u00e9ratures favorisant les plus petites formes, etc.<\/p>\n\n\n\n V\u00e9g\u00e9tation enracin\u00e9e<\/strong><\/p>\n\n\n\n Plus d\u2019un million de donn\u00e9es (1 019 112) de flore vasculaire issues de trois Conservatoires Botaniques Nationaux (Bassin Parisien, Brest et Massif Central) ont \u00e9t\u00e9 r\u00e9cup\u00e9r\u00e9es. Celles-ci correspondent \u00e0 des observations effectu\u00e9es sur une commune travers\u00e9e par la Loire ou un de ses affluents. La majorit\u00e9 (67%) concerne des donn\u00e9es ult\u00e9rieures \u00e0 1999 et seulement 5% la p\u00e9riode ant\u00e9rieure \u00e0 1950. Ont \u00e9galement \u00e9t\u00e9 ajout\u00e9es des donn\u00e9es de macrophytes aquatiques r\u00e9colt\u00e9es dans le cadre du r\u00e9seau de contr\u00f4le et de surveillance de la qualit\u00e9 des eaux de surface (RCS).<\/p>\n\n\n\n Secteurs d\u2019\u00e9tude de la v\u00e9g\u00e9tation enracin\u00e9e<\/em><\/p>\n\n\n\n L\u2019\u00e9volution temporelle du nombre de donn\u00e9es et d\u2019esp\u00e8ces par commune est analys\u00e9 \u00e0 l\u2019aide d\u2019un mod\u00e8le lin\u00e9aire g\u00e9n\u00e9ralis\u00e9 mixte (GLMM). La comparaison du nombre de donn\u00e9es et d\u2019esp\u00e8ces par secteur (7 secteurs au total) est effectu\u00e9e \u00e0 l\u2019aide d\u2019un test de Kruskall-Wallis suivi d\u2019un test de comparaison multiples par paires. Enfin l\u2019analyse des tendances temporelles est effectu\u00e9e sur 93 esp\u00e8ces en comparant les donn\u00e9es historiques issues de 17 Flores aux donn\u00e9es des CBN par l\u2019\u00e9tude des r\u00e9sidus de r\u00e9gressions lin\u00e9aires entre donn\u00e9es r\u00e9centes et historiques.<\/p>\n\n\n\n Pr\u00e8s de 2437 esp\u00e8ces sont pr\u00e9sentes dans les donn\u00e9es issues des CBN, avec le plus grand nombre d\u2019esp\u00e8ces d\u00e9tect\u00e9es sur la Loire amont et l\u2019Allier. L\u2019Allier semble mieux prospect\u00e9 que les autres secteurs alors que la Vienne et les Basses Vall\u00e9es Angevines le sont moins. Les donn\u00e9es issues du RCS comptent 113 taxons dont 20 taxons d\u2019algues, 19 d\u2019esp\u00e8ces de bryophytes et 69 taxons vasculaires. Macro-invert\u00e9br\u00e9s benthiques<\/strong><\/p>\n\n\n\n Des suivis annuels des macroinvert\u00e9br\u00e9s benthiques sont effectu\u00e9s sur la Loire depuis 1977 selon divers protocole et niveaux d\u2019identification. Les donn\u00e9es de 319 relev\u00e9s effectu\u00e9s sur 51 stations ont \u00e9t\u00e9 recueillies. Seules 27 stations correspondant au R\u00e9seau de Contr\u00f4le et de Surveillance de la qualit\u00e9 de l\u2019eau (RCS) sont utilis\u00e9es pour l\u2019analyse de la r\u00e9partition le long du gradient longitudinal de la Loire du fait de l\u2019identification plus fine (au genre et non \u00e0 la famille).<\/p>\n\n\n\n Un total de 310 taxons correspondant \u00e0 128 familles (dont 69% appartiennent \u00e0 la classe des insectes) a \u00e9t\u00e9 recens\u00e9 sur l\u2019ensemble des donn\u00e9es collect\u00e9es.<\/p>\n\n\n\n Distribution des familles de macroinvert\u00e9br\u00e9s benthiques de la Loire<\/em><\/p>\n\n\n\n Sur les 222 taxons observ\u00e9s sur les 27 stations du RCS, la Loire Amont (du Puy-en-Velay au Bec d\u2019Allier) est le secteur pr\u00e9sentant la richesse taxonomique la plus \u00e9lev\u00e9e avec 181 taxons (diversit\u00e9 relative de 80,1%) et la Loire aval (du bec de Vienne \u00e0 la limite de salure des eaux) le secteur le moins riche avec 87 taxons (diversit\u00e9 relative de 38,5%). Arthropodes terrestres<\/strong><\/p>\n\n\n\n Une synth\u00e8se de 9790 donn\u00e9es de macro-arthropodes terrestres provenant de divers organismes (GRETIA, MNHN, etc.) a \u00e9t\u00e9 effectu\u00e9e. Ces donn\u00e9es concernent sp\u00e9cifiquement les Aranaea<\/em> et les col\u00e9opt\u00e8res Carabidae<\/em>, groupes taxonomiques indicateurs de biodiversit\u00e9. Diff\u00e9rentes m\u00e9thodes d\u2019analyse de donn\u00e9es ont \u00e9t\u00e9 mises en oeuvre pour r\u00e9pondre \u00e0 l\u2019ensemble des questions de recherche : Analyse des Correspondances Multiples (ACM), Analyse Factorielle des Correspondances (AFC), Classification Ascendante Hi\u00e9rarchique (CAH) et r\u00e9gression lin\u00e9aire.<\/p>\n\n\n\n Les donn\u00e9es r\u00e9colt\u00e9es regroupent un total de 536 esp\u00e8ces d\u2019araign\u00e9es sur une p\u00e9riode d\u2019environ 20 ans et pr\u00e8s de 200 esp\u00e8ces sont sp\u00e9cifiques \u00e0 un seul secteur (amont, aval et t\u00eates de bassin). La richesse sp\u00e9cifique semble d\u00e9cro\u00eetre d\u2019aval en amont bien que la tendance ne soit pas significative. En revanche la richesse sp\u00e9cifique en esp\u00e8ces halophiles diminue significativement d\u2019aval en amont.<\/p>\n\n\n\n R\u00e9gression lin\u00e9aire de la richesse sp\u00e9cifique en Aranaea par site en fonction de la distance \u00e0 la mer<\/em><\/p>\n\n\n\n En ce qui concerne les col\u00e9opt\u00e8res Carabidae<\/em>, 285 esp\u00e8ces diff\u00e9rentes ont \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9es sur une p\u00e9riode d\u2019environ 10 ans. La grande majorit\u00e9 de ces esp\u00e8ces (168) sont exclusives au secteur amont et seules 15 esp\u00e8ces sont communes aux trois secteurs. Dispositif de capture par pi\u00e8ge Barber coupl\u00e9 \u00e0 un enregistreur de temp\u00e9rature<\/em><\/p>\n\n\n\n Avifaune<\/strong><\/p>\n\n\n\n Trois programmes de suivi de l\u2019avifaune ont \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9s pour r\u00e9aliser les analyses : l\u2019observatoire de l\u2019avifaune nicheuse des gr\u00e8ves sur le bassin de la Loire, le suivi temporel des oiseaux nicheurs en rivi\u00e8re et diverses \u00e9tudes de l\u2019avifaune prairiale.<\/p>\n\n\n\n Ces donn\u00e9es ont permis de recenser 312 esp\u00e8ces d\u2019oiseaux sur le territoire. La diminution des effectifs des esp\u00e8ces li\u00e9es aux fourr\u00e9s et l\u2019augmentation des populations d\u2019esp\u00e8ces foresti\u00e8res tend \u00e0 montrer un d\u00e9veloppement de la ripisylve.<\/p>\n\n\n\n![\"\"](\"http:\/\/www.za-loire.org\/wp-content\/uploads\/2019\/12\/illustration_paleoecologie.png\")
<\/figure>\n\n\n\nAction 1.2 : Tendances de dynamiques des esp\u00e8ces et communaut\u00e9s dans le pass\u00e9 proche<\/h3>\n\n\n\n
![\"\"](\"http:\/\/www.za-loire.org\/wp-content\/uploads\/2019\/12\/illustration_phytoplancton_carte.png\")
<\/figure>\n\n\n\n
Si aucun gradient longitudinal de la richesse taxonomique n\u2019est d\u00e9tect\u00e9, celle-ci semble plus \u00e9lev\u00e9e lors de la seconde p\u00e9riode d\u2019\u00e9chantillonnage, du fait notamment de l\u2019effort d\u2019identification plus \u00e9lev\u00e9 et de l\u2019\u00e9volution de la taxinomie. La variabilit\u00e9 intra-annuelle semble \u00e9galement avoir augment\u00e9, peut-\u00eatre en r\u00e9ponse \u00e0 des d\u00e9bits plus dynamiques.<\/p>\n\n\n\n![\"\"](\"http:\/\/www.za-loire.org\/wp-content\/uploads\/2019\/12\/illustration_phytoplancton_biomasse-717x1024.png\")
<\/figure>\n\n\n\n![\"\"](\"http:\/\/www.za-loire.org\/wp-content\/uploads\/2019\/12\/illustration_vegetation_carte-1024x802.png\")
<\/figure>\n\n\n\n
En ce qui concerne l\u2019\u00e9volution temporelle, les abondances anciennes sont proches des r\u00e9centes. En effet seules 27 esp\u00e8ces sur les 93 \u00e9tudi\u00e9es pr\u00e9sentent une tendance significative et pour 20 d\u2019entre-elles cette diff\u00e9rence entre donn\u00e9es r\u00e9centes et historiques ne concerne qu\u2019une seul flore ancienne.
Une analyse de Co-Inertie devra \u00eatre utilis\u00e9e ult\u00e9rieurement pour \u00e9tudier la distribution d\u2019assemblages en fonction des variables environnementales alors que diverses analyses exploratoires sont propos\u00e9es pour la distribution d\u2019esp\u00e8ces.<\/p>\n\n\n\n![\"\"](\"http:\/\/www.za-loire.org\/wp-content\/uploads\/2019\/12\/illustration_mib_familles.png\")
<\/figure>\n\n\n\n
Une augmentation des esp\u00e8ces envahissantes est \u00e9galement observ\u00e9e.<\/p>\n\n\n\n![\"\"](\"http:\/\/www.za-loire.org\/wp-content\/uploads\/2019\/12\/illustration_araignees_tendance.png\")
<\/figure>\n\n\n\n
Pour les deux groupes \u00e9tudi\u00e9s, chaque ensemble de relev\u00e9s mis en \u00e9vidence semble correspondre \u00e0 un cort\u00e8ge d\u2019esp\u00e8ces, avec \u00e0 la fois des esp\u00e8ces exclusives \u00e0 une zone donn\u00e9e et des esp\u00e8ces communes aux diff\u00e9rentes unit\u00e9s. La m\u00e9thode de capture par pi\u00e8ges Barber, dont les r\u00e9sultats s\u2019\u00e9loignent de ceux des autres m\u00e9thodes (battage, fauchage, chasse \u00e0 vue), semble la plus appropri\u00e9e pour un suivi \u00e0 long terme.<\/p>\n\n\n\n![\"\"](\"http:\/\/www.za-loire.org\/wp-content\/uploads\/2019\/12\/barber_beaugency-1024x770.jpg\")
<\/figure>\n\n\n\nResources<\/h3>\n\n\n\n
![\"\"](\"http:\/\/www.za-loire.org\/wp-content\/uploads\/2019\/12\/bandeau_inferieur_web_financeurs-2-2-1024x156.png\")
<\/figure>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"